La maestría cuenta con dos cursos obligatorios ofrecidos por los docentes de la maestría: Fundamentos en Ciencias Cognitivas y Neurociencia Cognitiva y Computacional. Existen además, dos tipos de cursos optativos: 1) los dictados anualmente por otros posgrados que son aceptados como parte de nuestra currícula si es coherente con el plan de estudios del estudiante; 2) los que se ofrecen puntualmente en determinadas ocasiones sin volver a reiterarse, tanto de la maestría en Ciencias Cognitivas, como de otros posgrados de la UdelaR.